A Gebruikte software

De volledige voorbereiding en statistische analyse voeren we uit in de statische software R (R Core Team, 2021). Voor de databewerkingen maken gebruiken van de packages tidyverse (Wickham et al., 2019) en sf (Pebesma, 2018). Met git2rdata (Onkelinx, 2021b) bewaren we de brondata in een open tekst formaat. Om de clustering efficient uit te voeren schreven we het territoria package (Onkelinx, 2021c). Bij de uiteindelijke analyse maken we gebruik van INLA (Rue et al., 2009).

References

Onkelinx T. (2021b). git2rdata: Store and Retrieve Data.frames in a Git Repository. https://CRAN.R-project.org/package=git2rdata.
Onkelinx T. (2021c). territoria: Clustering Observations from Breeding Birds into Territoria. https://github.com/inbo/territoria.
Pebesma E. (2018). Simple Features for R: Standardized Support for Spatial Vector Data. The R Journal 10 (1): 439–446. https://doi.org/10.32614/RJ-2018-009.
R Core Team (2021). R: A Language and Environment for Statistical Computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. https://www.R-project.org/.
Rue H., Martino S. & Chopin N. (2009). Approximate Bayesian Inference for Latent Gaussian Models Using Integrated Nested Laplace Approximations (with discussion). Journal of the Royal Statistical Society B 71: 319–392.
Wickham H., Averick M., Bryan J., Chang W., McGowan L.D., François R., Grolemund G., Hayes A., Henry L., Hester J., Kuhn M., Pedersen T.L., Miller E., Bache S.M., Müller K., Ooms J., Robinson D., Seidel D.P., Spinu V., Takahashi K., Vaughan D., Wilke C., Woo K. & Yutani H. (2019). Welcome to the tidyverse. Journal of Open Source Software 4 (43): 1686. https://doi.org/10.21105/joss.01686.

 

Creative Commons-Licentie Onkelinx, T. & Carmen, R. (2021). 10.21436/inbor.52401745