B Bijlage: reproduceerbaarheid van de analyse

De analyses in dit rapport zijn uitgevoerd via R (R Core Team, 2019). De R-code is onder versiebeheer geplaatst in de Github repository soortenmeetnetten-plants.

De repository bevat 3 R-scripts met voorbereidende stappen:

  • Het script import_ruwe_data.Rmd bevat de queries om de meetnetten.be databank te bevragen. De opgevraagde data wordt weggeschreven in de datalagen aantallen_ruw, locaties, tracks van het geopackage plantenmeetnetten.gpkg.

  • In het script selectie_analyseset.Rmd gebeurt een datacontrole en wordt de analyseset geselecteerd. Het resultaat wordt in de datalaag analyseset toegevoegd aan het geopackage plantenmeetnetten.gpkg.

  • In het script selectie_analyseset.Rmd gebeurt een datacontrole en wordt de analyseset geselecteerd. Het resultaat wordt in de datalaag analyseset toegevoegd aan het geopackage plantenmeetnetten.gpkg.

  • In het script combineer_bezoeken.Rmd combineren we verschillende tellingen die binnen eenzelfde jaar voor eenzelfde locatie zijn uitgevoerd. Het resultaat is de datalaag ‘analyseset_preprocessed’ die opnieuw wordt toegevoegd aan plantenmeetnetten.gpkg. Deze datalaag wordt gebruikt als input voor dit rapport.

De repository bevat ook de R-scripts voor het eigenlijke resultatenrapport. Deze scripts bevinden zicht in deze folder.

De geopackage plantenmeetnetten.gpkg wordt niet open beschikbaar gemaakt omdat het gevoelige informatie bevat over bedreigde soorten. Het bestand wordt wel bewaard in deze google drive folder die enkel intern binnen het INBO raadpleegbaar is.

Referenties

R Core Team (2019). R: A Language and Environment for Statistical Computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. https://www.R-project.org/.

 

Creative Commons-Licentie Westra, T., et. al. (2023). 10.21436/inbor.99216099