Functie die de validatie uitvoert op het verschoven Vlaams model en een overzicht geeft van de afwijkende metingen (zodat de gebruiker deze kan valideren).
validatie.afgeleid() roept meerdere hulpfuncties op:
Voorafgaand aan het uitvoeren van deze laatste functie worden eerst de slechtste modellen opgelijst (op basis van RMSE en afwijkende metingen).
validatie.afgeleid(
Basismodel,
Afgeleidmodel,
AantalDomHogeRMSE = 20,
ExtraCurvesRapport = NULL,
Bestandsnaam = "Validatie_Afgeleid.html",
TypeRapport = "Dynamisch",
PathWD = getwd()
)Model per boomsoort zoals teruggegeven door de functie
fit.basis(): tibble met de velden BMS (boomsoort) en Model
(lme-object met het gefit mixed model voor die boomsoort)
Model per boomsoort-domeincombinatie zoals teruggegeven
door de functie fit.afgeleid(): list met 2 tibbles.
Standaard worden de 20 domeinen met de hoogste
RMSE geselecteerd en voor elk van deze domeinen worden minstens 10
afwijkende metingen geselecteerd. AantalDomHogeRMSE laat toe om dit aantal
van 20 domeinen aan te passen.
Optie om een lijst met extra
boomsoort-domeincombinaties op te geven waardoor de curve getoond moet worden
in het validatierapport.
Deze moeten opgegeven worden als een dataframe met velden DOMEIN_ID en
BMS, met benamingen die overeenkomen met deze in de opgegeven dataset.
Een naam voor het validatierapport (.html-bestand) dat
gegenereerd wordt, bestaande uit een string die eindigt op .html
Default is "Dynamisch", waarbij de figuren in het
.html-bestand kunnen worden aangepast (meetgegevens weergeven door muis
erover te bewegen (inclusief ID als deze in de dataset meegegeven is),
items uit legende wegklikken, grafiek inzoomen,...). Een andere optie is
"Statisch", waarbij de figuren vast zijn.
Het path van de working directory, dus het path waarin het validatierapport opgeslagen moet worden (default wordt het in de op dat moment actieve working directory opgeslagen).
De functie genereert een validatierapport (.html-bestand) in de
working directory met informatie en grafieken van de te controleren metingen.
De afwijkende metingen zijn in rood aangeduid (zie ?validatierapport of
vignet voor meer informatie).
De functie geeft een dataframe terug met de te controleren metingen, met behalve de informatie uit de databank een aantal berekende waarden:
H_D_finaal: een geschatte hoogte voor de omtrekklasse volgens het
domeinmodel
rsmeD: de foutenschatting voor het domeinmodel
H_VL_finaal: een geschatte hoogte voor de omtrekklasse volgens het
Vlaams model waarvan het domeinmodel afgeleid is
rmseVL: de foutenschatting voor dit Vlaams model
HogeRmse: TRUE als het domeinmodel een hoge RMSE heeft, anders NA