
Stelt de slechtste curves en afwijkende metingen grafisch voor in een rapport
Source:R/validatierapport.R
validatierapport.Rd
De functie genereert een validatierapport (.html
-bestand) in de working
directory (of opgegeven directory) met informatie en grafieken van de te
controleren modellen. De afwijkende metingen en curvedelen zijn in rood
aangeduid; boven de curve is het probleem ook woordelijk beschreven.
Deze functie rendert het bestand Validatierapport.Rmd
, dat afhankelijk van
de opgegeven variabele TypeRapport
voor elke boomsoort-domeincombinatie als
child DomeincurveDynamisch.Rmd
of Domeincurve.Rmd
toevoegt.
Arguments
- SlechtsteModellen
Lijst van de slechtste modellen, dit zijn modellen met hoge RMSE, afwijkende vorm (op basis van extremen en buigpunten) en/of modellen met afwijkende metingen. Deze dataframe moet volgende velden bevatten:
BMS
(boomsoort),DOMEIN_ID
enReden
(= tekstuele opsomming van afwijkingen, om weer te geven boven grafiek).- AfwijkendeMetingen
Lijst met afwijkende metingen (dataframe zoals gegenereerd door de functie
afwijkendeMetingen()
).- Dataset
Dataset met gemeten waarden en geschatte waarde voor domeinmodel en Vlaams model (inclusief
RMSE
)- Bestandsnaam
Een naam voor het validatierapport (
.html
-bestand) dat gegenereerd wordt, bestaande uit een string die eindigt op.html
- TypeRapport
Default is "Dynamisch", waarbij de figuren in het
.html
-bestand kunnen worden aangepast (meetgegevens weergeven door muis erover te bewegen (inclusiefID
als deze in de dataset meegegeven is), items uit legende wegklikken, grafiek inzoomen,...). Een andere optie is "Statisch", waarbij de figuren vast zijn.- Uitbreidingsrapport
Gaat het over een validatierapport voor
validatie.uitbreiding()
? Default isFALSE
, wat betekent dat het validatierapport de standaard layout heeft voor de validatierapporten, met afwijkingen in rood en standaard informatie die getoond wordt. In het validatierapport voorvalidatie.uitbreiding()
is de uitbreiding die gevalideerd moet worden, in blauw weergegeven. Ook wijkt de weergegeven informatie iets af van de standaard.- verbose
Dit geeft de toestand van het systeem aan en zorgt ervoor dat boodschappen niet onnodig gegeven worden. (Defaultwaarde behouden.)
- PathWD
Het path van de working directory, dus het path waarin het validatierapport opgeslagen moet worden (default wordt het in de op dat moment actieve working directory opgeslagen).
Value
De functie genereert in de working directory (of opgegeven directory)
een rapport (.html
) met de te controleren modellen. Hierin wordt per model
(boomsoort-domeincombinatie) de volgende algemene informatie vermeld:
boomsoort, domein (en ID), aantal metingen, RMSE, bruikbaar interval en de
mogelijke problemen die bij het model optreden.
Daaronder wordt telkens grafisch volgende info weergegeven:
een puntenwolk die de metingen voorstelt (geen individuele metingen, maar een jitter)
curve van het Vlaams model (als beschikbaar, dus niet voor het lokaal model)
curve van het domeinmodel
grenzen van het bruikbaar interval (curves eindigen bij de klassenmiddens die overeenkomen met deze grenzen)
afwijkende metingen: in rood (andere metingen in zwart)
afwijkende deel van een curve in rood (rest van curve in zwart)
Bij de keuze voor een uitbreidingsrapport (argument
Uitbreidingsrapport = TRUE
) wijkt het rapport af:
algemene informatie: de RMSE is vervangen door de variabelen DiffMediaan, DiffMin en DiffMax
kleur van grafiek: geen afwijkingen in rood, wel is de uitbreiding weergegeven in blauw (zowel jitter van metingen als curve)