Genereert soortenlijst(en) LSVI op basis van de opgegeven parameters

Deze functie genereert soortenlijsten (met wetenschappelijke en Nederlandse namen) die gebruikt worden voor de bepaling van de Lokale Staat van Instandhouding van de opgegeven parameters. In feite genereert ze een tabel met velden Versie, Habitattype, Habitatsubtype, WetNaam, WetNaamKort en NedNaam en evt. Criterium, Indicator en/of Beschrijving waarin de gespecificeerde parameters uitgeselecteerd zijn en waar voor andere parameters alle waarden uit de databank weergegeven zijn.

Voor de vorm van de soortenlijst zijn er meerdere opties: een soortenlijst met alle soorten per habitat(sub)type, ofwel gegroepeerd per criterium, indicator of voorwaarde. Dit kan opgegeven worden in de parameter Taxonlijstniveau.

Ook voor de weergave van de taxa zijn 2 opties: de taxa weergeven zoals in de habitatfiches (op soortniveau, genusniveau of hoger niveau, zoals het in de habitatfiches vermeld is) of alle taxa op lagere niveaus ook weergeven en dus bij soortengroepen alle mogelijke soorten van deze groep weergeven. Deze opties kunnen opgegeven worden in de parameter Taxonlijsttype.

De parameters kunnen enkel de hieronder gespecifeerde waarden bevatten en moeten als string opgegeven worden. Default is telkens 'alle', waarbij de soortenlijsten voor alle mogelijke waarden van die parameter weergegeven worden (m.a.w. er is geen selectie voor deze parameter).

geefSoortenlijst(
  Versie = "alle",
  Habitatgroep = "alle",
  Habitattype = "alle",
  Criterium = "alle",
  Indicator = "alle",
  Taxonlijstniveau = c("habitattype", "criterium", "indicator", "voorwaarde"),
  Taxonlijsttype = c("LSVIfiche", "alle"),
  ConnectieLSVIhabitats = NULL
)

Arguments

Versie: De versie van het LSVI-rapport, bv. "Versie 2" of "Versie 3". Bij de default "alle" worden de gegevens voor de verschillende versies gegeven. De mogelijke waarden kunnen opgevraagd worden via geefUniekeWaarden("Versie", "VersieLSVI") of geefVersieInfo().
Habitatgroep: Parameter waarmee alle habitats van een bepaalde habitatgroep kunnen geselecteerd worden, bv. "Bossen", "Heiden", "(Half-)natuurlijke graslanden", "Zoete en brakke wateren",... en "alle" (=default). Deze waarde moet niet gespecifieerd worden als een bepaald habitat(sub)type geselecteerd wordt. De mogelijke waarden kunnen opgevraagd worden via geefUniekeWaarden("Habitatgroep", "Naam").
Habitattype: Parameter waarmee een habitattype of habitatsubtype kan geselecteerd worden. Als dit een habitattype betreft met meerdere subtypes, zullen de gegevens van alle subtypes van dit habitattype weergegeven worden. De mogelijke waarden kunnen opgevraagd worden via geefUniekeWaarden("Habitattype", "Code"). Er is voor deze parameter ook de mogelijkheid om een vector van meerdere habitat(sub)typen op te geven.
Criterium: Het LSVI-criterium waarvoor de gegevens geselecteerd worden: "Vegetatie", "Structuur", "Verstoring" of "alle".
Indicator: De indicator waarvoor de gegevens uit de databank gehaald worden. De mogelijke waarden kunnen opgevraagd worden via geefUniekeWaarden("Indicator", "Naam").
Taxonlijstniveau: Geeft aan op welk niveau de soortenlijst gegroepeerd is (en welke niveaus weergegeven worden in de soortenlijst), de mogelijke waarden zijn 'habitattype', 'criterium', 'indicator' en 'voorwaarde'. Default is 'habitattype'.
Taxonlijsttype: "LSVIfiche" betekent dat de taxonlijst van de habitatfiche wordt overgenomen, "alle" betekent dat alle soorten en alle taxonomische groepen worden weergegeven die volledig in de groepen vallen die aan de parameters voldoen.
ConnectieLSVIhabitats: Connectie met de databank met indicatoren voor de LSVI van habitats, in te stellen d.m.v. functie connecteerMetLSVIdb.

Value

Deze functie geeft een tabel met velden Versie, Habitattype, Habitatsubtype, Criterium, Indicator, evt. Beschrijving, WetNaam, WetNaamKort en NedNaam (waarbij Beschrijving een omschrijving is voor een groep van taxa binnen eenzelfde indicator). WetNaam is de volledige Latijnse naam inclusief auteursnaam, WetNaamKort geeft de verkorte naam zonder auteursnaam.

Examples

# Omwille van de iets langere lange duurtijd van de commando's staat bij
# onderstaande voorbeelden de vermelding 'dontrun' (om problemen te vermijden
# bij het testen van het package). Maar de voorbeelden werken en kunnen zeker
# uitgetest worden.
if (FALSE) {
maakConnectiePool()
geefSoortenlijst(Habitattype = "4030", Taxonlijsttype = "LSVIfiche")
geefSoortenlijst(Habitattype = "4030", Taxonlijsttype = "alle")
library(pool)
poolClose(ConnectiePool)
}